Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PPP1R2P1-210ENST00000429032 618 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms