Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms