Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms