Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms