Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms