Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P62684 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms