Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA2P51531 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms