Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms