Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms