Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMPOP42166 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMPOP42166 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMPOP42166 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms