Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC1P41238 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms