Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL1P40616 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms