Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms