Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPC1P35052 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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