Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH4A1P30038 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms