Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms