Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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