Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms