Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SCP2P22307 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCP2P22307 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCP2P22307 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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