Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms