Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms