Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKMT2P17540 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms