Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB1P16220 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB1P16220 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms