Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms