Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms