Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms