Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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