Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA2O43364 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms