Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms