Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF103O00237 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF103O00237 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF103O00237 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF103O00237 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF103O00237 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF103O00237 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF103O00237 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF103O00237 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF103O00237 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF103O00237 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms