Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms