Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms