Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms