Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms