Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
LAMC3Q9Y6N6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
LAMC3Q9Y6N6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
LAMC3Q9Y6N6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
LAMC3Q9Y6N6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
LAMC3Q9Y6N6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC3Q9Y6N6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms