Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms