Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF1Q9Y548 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF1Q9Y548 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms