Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HECTD4Q9Y4D8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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HECTD4Q9Y4D8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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HECTD4Q9Y4D8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HECTD4Q9Y4D8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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