Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIK3Q9Y2K2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK3Q9Y2K2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK3Q9Y2K2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms