Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX7Q9UNH6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX7Q9UNH6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX7Q9UNH6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms