Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN1Q9ULB1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN1Q9ULB1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN1Q9ULB1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms