Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC9Q9UKV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC9Q9UKV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms