Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROTQ9UKG9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CROTQ9UKG9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms