Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA2Q9UJY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA2Q9UJY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms