Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
STAG3Q9UJ98 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAG3Q9UJ98 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms