Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HERC5Q9UII4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERC5Q9UII4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC5Q9UII4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms