Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF20Q9UGU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms