Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF1Q9UBU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF1Q9UBU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms