Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms