Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG4Q9UBN1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG4Q9UBN1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms